More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3088 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3088  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 124 aa  247  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  50.91 
 
 		 137 aa  113  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  35.4 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  36.26 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  39.74 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  35.16 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  45.07 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  45.07 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  45.07 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  43.94 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  37 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  48.44 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.16 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  39.02 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  37.8 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  30.86 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  41.67 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  45.31 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  45.31 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  41.25 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  45.31 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  45.31 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  35 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  40.32 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>