More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2129 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  246  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  68.75 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  68.75 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 125 aa  157  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  63.96 
 
 		 125 aa  156  9e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  66.07 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  62.16 
 
 		 121 aa  153  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  63.06 
 
 		 125 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  61.26 
 
 		 121 aa  150  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  57.14 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  56.25 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  55.86 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  57.52 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  57.52 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  58.41 
 
 		 125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  56.64 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  56.64 
 
 		 125 aa  137  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  52.68 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  54.95 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  49.58 
 
 		 120 aa  129  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  45.3 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  50.43 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  52.25 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  47.93 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  49.55 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  47.32 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  50.48 
 
 		 118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  51.58 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  57.78 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  55.43 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  51.76 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  51.76 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 117 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  41.59 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  46.24 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  47.83 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  42.06 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  36.94 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  39.5 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  38.24 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  42.35 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  38.68 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  39.77 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  35.92 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>