More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5186 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 117 aa  239  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  60.98 
 
 		 105 aa  93.6  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  59.04 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  59.76 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  56.82 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  51.58 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  46.59 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  46.51 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  45.45 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  55.29 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  47.67 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  47.67 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  47.67 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  47.67 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  52.94 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  48.24 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  48.24 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  48.15 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  52.94 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  48.72 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.43 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  46.25 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2472  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  46.34 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  47.5 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  38.61 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  39.82 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  45.78 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  45.78 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  46.25 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  45.88 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  45.88 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  45.88 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  39.82 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  44.83 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3418  ArsR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00835555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2752  transcriptional regulator, TrmB  50.65 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  48.19 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  44.71 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  48.68 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1145  regulatory protein ArsR  51.76 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0923  transcriptional regulator, TrmB  46.75 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1304  transcriptional regulator, TrmB  50.59 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  43.53 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  43.68 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  32.22 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3556  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.859788  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>