More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1102 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  59.15 
 
 
222 aa  258  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  58.8 
 
 
222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  54.42 
 
 
227 aa  252  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
223 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  57.08 
 
 
223 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  55.25 
 
 
221 aa  238  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  54.13 
 
 
233 aa  236  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  55.4 
 
 
230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  54.09 
 
 
224 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
235 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
235 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
235 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  54.93 
 
 
231 aa  230  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  51.89 
 
 
218 aa  229  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  52.47 
 
 
224 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 
227 aa  228  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  49.78 
 
 
226 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  51.42 
 
 
218 aa  221  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  54.03 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  52.27 
 
 
221 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  51.83 
 
 
223 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  51.82 
 
 
221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  51.82 
 
 
221 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
218 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  49.09 
 
 
222 aa  201  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 
221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
226 aa  198  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  46.83 
 
 
234 aa  198  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  49.04 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  44.91 
 
 
226 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
221 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
220 aa  190  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
253 aa  184  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
219 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
227 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  44.13 
 
 
184 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  39.41 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
189 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  59.46 
 
 
124 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  59.46 
 
 
124 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  54.72 
 
 
114 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  41.49 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  45.07 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  30.82 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  33.04 
 
 
111 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
109 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  49.35 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  39.42 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  40.78 
 
 
112 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  40.78 
 
 
112 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  42.53 
 
 
113 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 
141 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
105 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
111 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
138 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
98 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 
145 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
109 aa  62.4  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  41.11 
 
 
129 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
105 aa  62  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
110 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3248  rhodanese-like protein  50 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  45.45 
 
 
121 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33.94 
 
 
177 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 
110 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
123 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
98 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  40.66 
 
 
110 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 
110 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  38.46 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  34.34 
 
 
117 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
116 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
167 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  46.75 
 
 
121 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  34.23 
 
 
114 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  46.75 
 
 
121 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  47.54 
 
 
99 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
106 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
93 aa  58.9  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.94 
 
 
189 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
167 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
106 aa  58.9  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 
107 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 
109 aa  58.5  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
107 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 
107 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  40.21 
 
 
120 aa  58.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
104 aa  58.5  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  43.21 
 
 
106 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  45.12 
 
 
107 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 
97 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
104 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  33.33 
 
 
117 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>