More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0092 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  100 
 
 		 184 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  43.72 
 
 		 222 aa  178  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 223 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  44.63 
 
 		 218 aa  169  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 233 aa  168  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  44.07 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 230 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 224 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 224 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 224 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 224 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 224 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 228 aa  167  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  44.63 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 231 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  43.65 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  43.26 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  42.54 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 221 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  42.54 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  42.37 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  40.78 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 189 aa  144  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 220 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 218 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 226 aa  130  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 219 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  35.2 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 221 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 253 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  35.2 
 
 		 222 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  33.73 
 
 		 219 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  43.69 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  32.79 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 124 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  40.71 
 
 		 124 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  35.83 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 		 252 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.59 
 
 		 550 aa  60.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  33.81 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  34.26 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  34.44 
 
 		 247 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 111 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 		 147 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  28.87 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  28.91 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  28.91 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  28.83 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  32.65 
 
 		 136 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  25.89 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  25.89 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  31.36 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  32.26 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  35.19 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  27.18 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  27.18 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  34.83 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  32.91 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  35.37 
 
 		 113 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  34.92 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.46 
 
 		 568 aa  51.6  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  34.83 
 
 		 148 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  27.72 
 
 		 423 aa  51.2  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  29.25 
 
 		 112 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2096  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 255 aa  51.2  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  29.9 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 		 112 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  35.14 
 
 		 363 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  29.91 
 
 		 551 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  31 
 
 		 478 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 127 aa  50.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>