More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1278 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  458  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  74.55 
 
 		 230 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  73.87 
 
 		 224 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  74.09 
 
 		 224 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  74.09 
 
 		 224 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  74.09 
 
 		 224 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  74.09 
 
 		 224 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  73.64 
 
 		 224 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  64.38 
 
 		 221 aa  275  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  64.38 
 
 		 221 aa  274  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  61.47 
 
 		 221 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  56.68 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 223 aa  241  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  52.7 
 
 		 222 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  53.67 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  51.64 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 223 aa  211  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  50.93 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  48.84 
 
 		 218 aa  208  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  50.23 
 
 		 226 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  47.64 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 220 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 253 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  48.11 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  43.5 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  71.93 
 
 		 124 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  71.93 
 
 		 124 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  41.76 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  39.91 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  42.13 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  61.06 
 
 		 114 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  42.37 
 
 		 128 aa  88.6  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  41.9 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 112 aa  72  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 110 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  42.67 
 
 		 102 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.86 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  39.62 
 
 		 112 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 102 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  40.7 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  40.45 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  39.36 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.95 
 
 		 471 aa  65.5  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  45.98 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  39.36 
 
 		 423 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  35.35 
 
 		 380 aa  65.1  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 		 111 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 136 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  40.51 
 
 		 820 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  34.31 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  36.59 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 		 480 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  33.91 
 
 		 117 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 		 111 aa  62  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  40.96 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 112 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  41.77 
 
 		 110 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  28 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0437  rhodanese domain-containing protein  43.9 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  42.86 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  28 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  40.96 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  41.38 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.58 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  42.55 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>