More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1715 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  53.67 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  50.47 
 
 		 218 aa  202  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  51.69 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  46.41 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  49.55 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  46.82 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  47.96 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  46.04 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  42.03 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  40.67 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  43.75 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  40.1 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 234 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  33.68 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 124 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  50.39 
 
 		 124 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  53.93 
 
 		 114 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  47.06 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  43.88 
 
 		 567 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05707  hypothetical protein  37.38 
 
 		 567 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 98 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  34.83 
 
 		 102 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  37.25 
 
 		 112 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  37.25 
 
 		 112 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  39.51 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.19 
 
 		 550 aa  62.8  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  40.48 
 
 		 106 aa  62  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.04 
 
 		 383 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  35.54 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  37.23 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  41.18 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  35.79 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  41.05 
 
 		 98 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000099  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.07 
 
 		 567 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 111 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.19 
 
 		 566 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  39.53 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  41.25 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  34.74 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  34.74 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  32 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  39.77 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>