More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2180 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  75.23 
 
 		 234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  53.24 
 
 		 219 aa  244  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  49.3 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 222 aa  228  8e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 235 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 235 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 235 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  43.54 
 
 		 223 aa  191  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  44.95 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  41.15 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  40.2 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  40.49 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  40.98 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  40.98 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  37.56 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  39.77 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 124 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  48 
 
 		 124 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  42.57 
 
 		 114 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  47.11 
 
 		 128 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.47 
 
 		 938 aa  62.8  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.78 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  43.21 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.46 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  27.88 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.24 
 
 		 563 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000959863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2650  Rhodanese domain protein  25.69 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.846466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4959  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1579  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  44.3 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 111 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.79 
 
 		 383 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 116 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 124 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  35.14 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  35.14 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.21 
 
 		 550 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.47 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  36.9 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3248  rhodanese-like protein  38.03 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  38.81 
 
 		 341 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  40.28 
 
 		 471 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 376 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 103 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 271 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  43.06 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  35.79 
 
 		 102 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 		 459 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  39.02 
 
 		 423 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  26.19 
 
 		 146 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  31.73 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 104 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 317 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 132 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 102 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  26.19 
 
 		 124 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>