More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3257 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  86.36 
 
 
221 aa  367  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  85 
 
 
221 aa  360  9e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  62.39 
 
 
230 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  62.39 
 
 
224 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  62.39 
 
 
224 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  62.39 
 
 
224 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  62.39 
 
 
224 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  61.93 
 
 
224 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  61.47 
 
 
231 aa  275  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  60.09 
 
 
224 aa  271  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
233 aa  234  7e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  48.4 
 
 
227 aa  226  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  51.82 
 
 
228 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  51.4 
 
 
218 aa  217  8.999999999999998e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  51.64 
 
 
222 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 
222 aa  215  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
223 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  49.3 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  50.23 
 
 
223 aa  211  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  48.36 
 
 
221 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  47.44 
 
 
218 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  46.95 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  46.95 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  46.95 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  44.81 
 
 
227 aa  190  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 
221 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  46.48 
 
 
226 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
226 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
218 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  44.81 
 
 
223 aa  174  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  43.26 
 
 
184 aa  169  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  41.31 
 
 
221 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
220 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
219 aa  158  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
234 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  40 
 
 
219 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
189 aa  152  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  38.97 
 
 
222 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
221 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
226 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
232 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
253 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  64.81 
 
 
124 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  64.81 
 
 
124 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  54.46 
 
 
114 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  42.65 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  44.12 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 
463 aa  65.1  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  36.63 
 
 
170 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
117 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
113 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  42.67 
 
 
119 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 
111 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
98 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
123 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  39.74 
 
 
119 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
105 aa  62.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 
121 aa  62  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.4 
 
 
361 aa  62  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  43.94 
 
 
118 aa  62  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  38.54 
 
 
186 aa  61.6  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
110 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
110 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  39.51 
 
 
136 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 
125 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  44.93 
 
 
105 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
100 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  44.59 
 
 
114 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 
125 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
121 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 
113 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.5 
 
 
136 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  37.88 
 
 
114 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 
102 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 
106 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
134 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 
138 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 
102 aa  58.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
377 aa  58.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 
125 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
120 aa  58.2  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
108 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 
109 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
110 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 
172 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
106 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 
106 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 
102 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
102 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
116 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.4 
 
 
478 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
106 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
110 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  25.93 
 
 
124 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 
112 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>