More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4328 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  56.28 
 
 
222 aa  246  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
228 aa  231  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  51.58 
 
 
226 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
226 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  50.88 
 
 
224 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  51.32 
 
 
222 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
224 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
224 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
224 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
230 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
224 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
224 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  51.12 
 
 
231 aa  221  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
223 aa  221  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
233 aa  218  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
218 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  48.64 
 
 
227 aa  213  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  49.77 
 
 
220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 
221 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  52.53 
 
 
223 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  48.82 
 
 
218 aa  210  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  45.41 
 
 
234 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  48.83 
 
 
227 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  44.24 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  46.7 
 
 
218 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  44.6 
 
 
223 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  45.71 
 
 
218 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
219 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
221 aa  191  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  47.27 
 
 
221 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  47.2 
 
 
221 aa  184  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  46.26 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  46.95 
 
 
221 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
226 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  48.09 
 
 
184 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  41.09 
 
 
219 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
227 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  39.89 
 
 
189 aa  146  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  37.17 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
124 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  51.79 
 
 
124 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  46.36 
 
 
114 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  50.75 
 
 
128 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  36.45 
 
 
170 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
111 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
101 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.25 
 
 
471 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  44.3 
 
 
102 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
116 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 
141 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 
129 aa  59.3  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 
113 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 
129 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
136 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
100 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  40.7 
 
 
112 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 
129 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  40.7 
 
 
112 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 
136 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
109 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  30.56 
 
 
132 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 
120 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 
550 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 
144 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 
121 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  32.5 
 
 
98 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 
144 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  32.14 
 
 
108 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 
472 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
113 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
118 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 
129 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
110 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
113 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
111 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
133 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
117 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 
125 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 
125 aa  55.5  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 
109 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
111 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.48 
 
 
109 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
115 aa  55.1  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  31.18 
 
 
129 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
290 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
103 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
107 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
129 aa  54.3  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
114 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
102 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
317 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.34 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
112 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  33.67 
 
 
105 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>