More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2736 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 228 aa  252  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  53.7 
 
 		 222 aa  247  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 224 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  54.5 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 230 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 233 aa  233  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  51.66 
 
 		 218 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  49.32 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  48.87 
 
 		 221 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  47.51 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  49.53 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  48.4 
 
 		 221 aa  214  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  49.29 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  47.2 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  42.92 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  43.93 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 253 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 189 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  41.67 
 
 		 184 aa  161  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  39.41 
 
 		 219 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  38.25 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  52.14 
 
 		 124 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 124 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  53.77 
 
 		 114 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 128 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  43.16 
 
 		 110 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  33.33 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  34.83 
 
 		 353 aa  65.1  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  30.06 
 
 		 423 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 106 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 116 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 141 aa  62  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 116 aa  62  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 129 aa  62  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.08 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 118 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 111 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  36.94 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 98 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 		 113 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  33.68 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 109 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0437  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 		 102 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 		 550 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 105 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  38.46 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.04 
 
 		 562 aa  60.1  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.563654  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  35.37 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  33.98 
 
 		 484 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.96 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  33.98 
 
 		 484 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  39.51 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>