More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3468 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  95.02 
 
 
221 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  85 
 
 
221 aa  360  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  64.38 
 
 
231 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  63.01 
 
 
224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  63.01 
 
 
224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  63.01 
 
 
224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  63.01 
 
 
230 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  63.01 
 
 
224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  62.56 
 
 
224 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  61.19 
 
 
224 aa  279  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  56.28 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  48.87 
 
 
227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
228 aa  229  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  50.68 
 
 
222 aa  228  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  53.05 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  50.23 
 
 
222 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  51.87 
 
 
218 aa  215  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  51.64 
 
 
221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  49.77 
 
 
218 aa  211  7.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  44.81 
 
 
223 aa  209  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
235 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
235 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
235 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  47.91 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  49.55 
 
 
221 aa  190  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  46.95 
 
 
226 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  46.23 
 
 
227 aa  185  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
218 aa  177  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
227 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  42.92 
 
 
226 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  47.42 
 
 
223 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  43.65 
 
 
184 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  43.19 
 
 
219 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
221 aa  162  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
234 aa  161  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  38.5 
 
 
219 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 
222 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
189 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
253 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  66.06 
 
 
124 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  66.06 
 
 
124 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
226 aa  147  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  39.37 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  53.1 
 
 
114 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  38.53 
 
 
170 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
93 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  39.71 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  44.12 
 
 
118 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  32.39 
 
 
463 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  41.33 
 
 
98 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
111 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
117 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  44 
 
 
119 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
121 aa  62.4  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
105 aa  62  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
113 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  41.03 
 
 
119 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
110 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  35 
 
 
133 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  26 
 
 
146 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
123 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 
105 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  26 
 
 
124 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 
114 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
100 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 
118 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  38.46 
 
 
353 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  44.74 
 
 
114 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
121 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
125 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
125 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
380 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.8 
 
 
361 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  33.93 
 
 
138 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 
112 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
113 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
110 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
102 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 
102 aa  58.5  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 
125 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 
102 aa  58.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
102 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 
106 aa  58.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
134 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  34.52 
 
 
108 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.71 
 
 
472 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  43.53 
 
 
471 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
106 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  38.04 
 
 
120 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 
106 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
120 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 
171 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  40 
 
 
115 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 
109 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>