More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1540 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
105 aa  208  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  38.37 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
110 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  34.09 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  35.37 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  34.48 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  41.56 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  33.73 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0013  regulatory protein ArsR  32.94 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  38.64 
 
 
227 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  31.63 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  29.55 
 
 
100 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  29.55 
 
 
100 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  30.34 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  34.38 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  34.38 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  31.33 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  34.38 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  40.26 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  32.58 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
101 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  31.46 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
111 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  35.62 
 
 
125 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  28.41 
 
 
95 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  34.44 
 
 
121 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>