More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0987 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 98 aa  200  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.77 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.77 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  42.17 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  41.46 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  43.21 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  41.03 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  41.56 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  40.96 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  43.06 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5228  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  36.46 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  41.56 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0013  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  28.89 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  34.88 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  37.36 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  35.37 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  37.18 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>