More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1557 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  42.53 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  43.28 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  44.44 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  29.79 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  34.83 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  43.06 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  38.16 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  33.33 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  36.26 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2884  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.301684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  36.26 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  37.93 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  37.04 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  35.87 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  37.04 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>