More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1891 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  266  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  63.41 
 
 		 132 aa  167  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  62.6 
 
 		 125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  61.79 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  60.16 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 111 aa  153  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  38.18 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  43.01 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  32.73 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  35.35 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  33.03 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  34.83 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  28.72 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  38.67 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  39.71 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  33 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 122 aa  57  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 341 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  37.63 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  41.18 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  28.71 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  34.21 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  31.03 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 337 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>