More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2011 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 135 aa  276  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  78.43 
 
 		 119 aa  169  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  55.43 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  48.04 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  48 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  47 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  47.75 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  45.65 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  46 
 
 		 130 aa  87  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  45.65 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  42.55 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  39.36 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  45.98 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.56 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  43.16 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  39.36 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  31.73 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  43.62 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  44.87 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  44.87 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2907  ArsR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  44.58 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  45.65 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  38.37 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>