More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3434 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 174 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  41.28 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  48.81 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  41.32 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  46.43 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  45.1 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  42.35 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  38.66 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  38.66 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  45.24 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  35.45 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  48.81 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1776  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  35.51 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  35.45 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  32.71 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  46.34 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2614  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2907  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>