More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3138 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  79.61 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  75.96 
 
 		 141 aa  163  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  73.58 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  76.47 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  67.83 
 
 		 138 aa  153  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  55.96 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 121 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  49.47 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  40.52 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  43.62 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  38.36 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  46.91 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  39.73 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.36 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  34.25 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  32.97 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  43.52 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  35 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  43.48 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 174 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  30.61 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>