More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0925 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
122 aa  249  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  69.03 
 
 
125 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  64.75 
 
 
124 aa  171  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  69.03 
 
 
121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  64.75 
 
 
124 aa  170  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  64.75 
 
 
124 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  63.72 
 
 
119 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  66.67 
 
 
121 aa  164  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  62.83 
 
 
119 aa  163  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  64.86 
 
 
125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  66.07 
 
 
121 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  56.3 
 
 
120 aa  148  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  61.4 
 
 
125 aa  147  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  61.4 
 
 
125 aa  147  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  62.28 
 
 
125 aa  147  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  60.53 
 
 
125 aa  146  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  61.4 
 
 
125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  61.4 
 
 
125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  61.4 
 
 
125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  61.4 
 
 
125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  61.4 
 
 
125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  60.53 
 
 
125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  61.4 
 
 
125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 
125 aa  144  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  60.36 
 
 
125 aa  142  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  55.56 
 
 
119 aa  136  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  53.78 
 
 
133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  51.43 
 
 
117 aa  120  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  54.13 
 
 
123 aa  120  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  49.57 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  57.89 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  49.55 
 
 
119 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  55.24 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
122 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  48.21 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  51.79 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 
173 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  46.79 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  48.67 
 
 
120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
139 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  59.3 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 
118 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
122 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
131 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 
141 aa  100  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  55.43 
 
 
100 aa  99.8  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 
124 aa  97.1  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  40.71 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  42.73 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  43.93 
 
 
126 aa  94  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 
109 aa  92.8  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  43.69 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  50.59 
 
 
117 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
109 aa  87  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.52 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
120 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  42.2 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
132 aa  84  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  39.64 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  36.28 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  38.82 
 
 
118 aa  76.6  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  33.96 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  37.8 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1839  transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000260966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  42.17 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  37.89 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>