More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2654 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
109 aa  215  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  68.69 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  59.8 
 
 
133 aa  121  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  57.28 
 
 
135 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1839  transcriptional regulator, ArsR family  71.7 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000260966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 
122 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  56.38 
 
 
145 aa  103  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  45.54 
 
 
121 aa  103  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  42.57 
 
 
121 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  49 
 
 
119 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  48 
 
 
119 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  53.68 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  52 
 
 
173 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  51.09 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
125 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  47 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  53.49 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  40 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  41.58 
 
 
125 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
117 aa  87.8  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
123 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
122 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  39.25 
 
 
124 aa  87  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  39.25 
 
 
124 aa  87  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  49.49 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  35.35 
 
 
125 aa  84  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 
125 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  45.56 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
127 aa  76.6  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  45.83 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  39.56 
 
 
109 aa  73.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  40.7 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  36.56 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  36.05 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  54.67 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  43.14 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  37.36 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
102 aa  66.6  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  36.17 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2062  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2108  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777393  normal  0.0654079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2045  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4059  regulatory protein, ArsR  45.78 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.507544  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>