More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1139 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 118 aa  243  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  81.36 
 
 		 117 aa  189  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  68.47 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  73.74 
 
 		 104 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  52.43 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  52.29 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  43.53 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  42.35 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  43.82 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  42.35 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1048  hypothetical protein  44.68 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  40.7 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  41.24 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  38.82 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  38.61 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 131 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  44.05 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  44.05 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2884  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.301684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  37.21 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  36.44 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  36.05 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>