More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10842 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  100 
 
 		 130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  77.78 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  81.48 
 
 		 141 aa  182  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  79.63 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  74.77 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  69.92 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  69.92 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  79.61 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  55.65 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  49.47 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  46 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  49.33 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  36.78 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  39.13 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  35.63 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  40.21 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  41.56 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  42.53 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  40.54 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  35.62 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  36.73 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  38.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  29.35 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  35.63 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  38.64 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  41.46 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  36.11 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  31.54 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  35.62 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>