More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2744 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 124 aa  246  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  66.97 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  75 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  73.86 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  68.42 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  69.89 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  66.67 
 
 		 103 aa  120  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  61.46 
 
 		 101 aa  120  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  67.44 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  64.2 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  37.63 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  37.63 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  33.06 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  31.62 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  34.41 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  43.24 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  36.56 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  27.27 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  32.29 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  34.86 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  41.86 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  31.31 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  28.69 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  32.1 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  44.57 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>