More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0245 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  259  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  75.22 
 
 		 124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  75.21 
 
 		 121 aa  187  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  75.22 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  75.22 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  76.52 
 
 		 121 aa  185  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  71.17 
 
 		 125 aa  176  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  68.38 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  69.03 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  66.67 
 
 		 119 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  60.83 
 
 		 125 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  61.06 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 121 aa  157  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  59.17 
 
 		 125 aa  157  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  59.17 
 
 		 125 aa  156  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  57.5 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  57.5 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  57.5 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  59.48 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  54.24 
 
 		 125 aa  145  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  53.98 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  58.41 
 
 		 133 aa  133  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  52.59 
 
 		 119 aa  133  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  56.41 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  49.58 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  49.14 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  48.21 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 		 173 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  53.98 
 
 		 123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  63.16 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  48.21 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  64.13 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  55.32 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  51.33 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  42.98 
 
 		 122 aa  110  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  48.72 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  56.67 
 
 		 93 aa  107  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  56.47 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  42.34 
 
 		 119 aa  103  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  39.83 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  48.51 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  52.87 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  36.75 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  44.25 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  47.17 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  53.41 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  50.59 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  50.59 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 127 aa  95.9  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  40.35 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  44.25 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  45.79 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  45.79 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  42.73 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  40.52 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  41.38 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  36.97 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  47.25 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  41.28 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  41.67 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  41.57 
 
 		 98 aa  84  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  49.32 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  37.63 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1839  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000260966  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  41.76 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>