More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1613 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  100 
 
 
124 aa  254  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
124 aa  254  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  99.19 
 
 
124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  75.22 
 
 
125 aa  186  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  70.8 
 
 
125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  68.6 
 
 
121 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  64.75 
 
 
122 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  66.12 
 
 
121 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  68.1 
 
 
119 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  67.24 
 
 
119 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  68.75 
 
 
121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  62.81 
 
 
120 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  62.93 
 
 
125 aa  156  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  61.21 
 
 
125 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  61.21 
 
 
125 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  61.21 
 
 
125 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  61.21 
 
 
125 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  61.21 
 
 
125 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  61.21 
 
 
125 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  61.21 
 
 
125 aa  154  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  61.95 
 
 
125 aa  154  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  61.21 
 
 
125 aa  154  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  63.16 
 
 
125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  62.07 
 
 
125 aa  153  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  60.53 
 
 
125 aa  149  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  58.62 
 
 
120 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  53.51 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  54.13 
 
 
123 aa  124  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 
122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  51.35 
 
 
119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 
133 aa  123  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  53.98 
 
 
122 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  50.86 
 
 
123 aa  121  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 
120 aa  121  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  63.16 
 
 
123 aa  120  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  58.06 
 
 
111 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  49.11 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 
173 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  49.53 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  47.79 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  50.44 
 
 
122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  63.04 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  52.88 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
139 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  40.5 
 
 
124 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 
126 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  58.89 
 
 
93 aa  104  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
100 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  45.37 
 
 
119 aa  102  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  51.69 
 
 
106 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
132 aa  100  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  38.79 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  54.12 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 
135 aa  97.1  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  52.44 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
127 aa  94.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
131 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  44.66 
 
 
114 aa  94  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 
140 aa  94  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  42.34 
 
 
122 aa  92  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
129 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
129 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  42.86 
 
 
122 aa  89  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 
102 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  43.88 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 
122 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
109 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
120 aa  87  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  39.5 
 
 
122 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  38.94 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  37.27 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  38.95 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  43.68 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  43.68 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  39.42 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  42.7 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  45.21 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>