More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5816 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 129 aa  253  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  63.53 
 
 		 132 aa  116  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  49.5 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  56.1 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  42.72 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  43.52 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  43.52 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  41.49 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  42.7 
 
 		 137 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  43.3 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  45.71 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  50.68 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  42.31 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  37.63 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  34.31 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  43.33 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  36.46 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  31.91 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1821  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0345143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  44.32 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  38.82 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  41.3 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  35.48 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  37.36 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  49.15 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  48.61 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1304  transcriptional regulator, TrmB  44.12 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  36.17 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  27.59 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1145  regulatory protein ArsR  42.65 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  37.97 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  44.59 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 221 aa  52.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  29.25 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>