More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3827 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  254  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  80.8 
 
 		 125 aa  202  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  51.55 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  44.76 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  54.37 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  42.22 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  42 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  40.45 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  35.96 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  39.78 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4283  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  43.04 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  45.45 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  41.05 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  35.05 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  30.77 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1206  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  30.77 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  40.26 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  31.73 
 
 		 358 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  28.45 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0892  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  34.19 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>