More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0183 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  56.82 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  60.49 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  58.97 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  54.32 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  52.33 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  54.76 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  49.38 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  46.91 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  46.91 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  43.82 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  41.57 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  40.96 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  43.06 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 233 aa  67  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  45.71 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  35.58 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  34.57 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  34.57 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  33.98 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  46.15 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  41.89 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 84 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  51.56 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  48.44 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  39.74 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  39.19 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  47.62 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>