More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4063 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  60.71 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  51.09 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  57.14 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  53.01 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  61.54 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  55.13 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  53.95 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  45.57 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  44.83 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  41.75 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  47.3 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  50 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 337 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  47.22 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  50.72 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  45 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  45 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  35.63 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  33.64 
 
 		 336 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  41.98 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 337 aa  60.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  47.89 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40.54 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  46.27 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  39.56 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  41.57 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  48.44 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 347 aa  57.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>