More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3497 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
121 aa  236  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  52.38 
 
 
135 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  52.38 
 
 
134 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  51.04 
 
 
138 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  58.02 
 
 
117 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  52.69 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  52.69 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
128 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  50.48 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  54.12 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  54.12 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  54.12 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  55.56 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  55.7 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  53.93 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  55.7 
 
 
127 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  49.46 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  49.46 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  53.09 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  52.44 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  50 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  53.75 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  50.65 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
107 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  44.57 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  60.49 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  54.93 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  43.42 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  42.17 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  40.96 
 
 
102 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  41.43 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  39.13 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  41.43 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  39 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  49.25 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  37.25 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 
105 aa  62  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  35.56 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  42.5 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>