More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0047 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  100 
 
 		 112 aa  226  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  55.75 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  53.04 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  47.79 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  46.9 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  50.65 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0522  ArsR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  39.09 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2952  ArsR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  53.62 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 317 aa  77  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  56.72 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 258 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50.63 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  39.64 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  48.57 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  41 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  43.66 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  51.47 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.44 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  48.57 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  51.43 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  41.44 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  41.44 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  47.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.44 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  40.43 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.44 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  41.44 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.44 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  37.89 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  42.17 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  51.56 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  38.18 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.72 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  38.46 
 
 		 306 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  56.72 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  50.72 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  50.72 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.81 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  56.72 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  47.62 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  50 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  47.95 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  56.72 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  56.45 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.24 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  46.38 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  44.71 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50.72 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  45 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.24 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  44.19 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.24 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  46.43 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>