More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5742 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
136 aa  273  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  85.07 
 
 
134 aa  226  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  83.09 
 
 
135 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  78.36 
 
 
129 aa  184  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  78.36 
 
 
129 aa  184  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  70.59 
 
 
138 aa  184  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  77.24 
 
 
129 aa  179  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  81.08 
 
 
127 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  71.19 
 
 
128 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  75 
 
 
127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  70.43 
 
 
124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  70.43 
 
 
124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  70.43 
 
 
124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  77.14 
 
 
118 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  77.14 
 
 
118 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  78.49 
 
 
127 aa  151  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  67.52 
 
 
119 aa  147  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  76.34 
 
 
127 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  80.39 
 
 
143 aa  147  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  68.57 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  73.08 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  72.44 
 
 
125 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  72.44 
 
 
145 aa  141  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  72.44 
 
 
125 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  70.37 
 
 
117 aa  141  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  69.81 
 
 
117 aa  135  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  70.41 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  69.31 
 
 
126 aa  134  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  57.89 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  64.36 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  66.32 
 
 
124 aa  110  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  68.92 
 
 
94 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  59.79 
 
 
141 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  53.76 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  56.7 
 
 
134 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
116 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  37.37 
 
 
129 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5331  putative transcriptional regulator  63.64 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0697124  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5679  putative transcriptional regulator  63.64 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.455024 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  47.83 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
133 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  44.44 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  37.63 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  36.54 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2208  putative transcriptional regulator  47.3 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  37.93 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  41.79 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 
119 aa  60.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
109 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  46.25 
 
 
118 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  33.75 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  46.48 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  38.95 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  31.53 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>