More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  86.84 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  67.52 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  68.81 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  69.16 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  67.86 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  68.18 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  68.52 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  68.52 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  64.81 
 
 		 120 aa  140  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  61.21 
 
 		 117 aa  140  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  66.97 
 
 		 129 aa  139  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 124 aa  137  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 124 aa  137  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 124 aa  137  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  63.96 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  65.14 
 
 		 113 aa  136  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  68 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  67 
 
 		 127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  70 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  62.93 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  62.93 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  60.58 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  69.23 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  69.23 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  70.59 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  65.45 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  57.27 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  64.21 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  66.67 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  53.76 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  58 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  55.67 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  50.48 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5331  putative transcriptional regulator  61.22 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0697124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5679  putative transcriptional regulator  61.22 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  35.96 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  39.58 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  35.71 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  43.28 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  35.34 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  49.28 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  28.16 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  41.54 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  36.19 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  38.3 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  38.67 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>