More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2549 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  86.41 
 
 
103 aa  184  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  56.06 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  36.96 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  43.59 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  45 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  44.59 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  43.37 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  46.03 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  48.48 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  44.87 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  43.37 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
119 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
120 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  43.37 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
92 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
102 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
102 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  43.66 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
122 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
114 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  41.86 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  36.99 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  36.62 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  41.25 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
437 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>