More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2556 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 119 aa  237  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  44.93 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  44.29 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  42.67 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  40.51 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  31.91 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  48.44 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  40.45 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  40.85 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  49.15 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  32.81 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  26.26 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  33.63 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  32.56 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 337 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1768  regulatory protein ArsR  36.14 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  31.4 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  34.43 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  31.4 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  31.4 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>