More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1768 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1768  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 112 aa  229  9e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  39.24 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  44.59 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  43.24 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1931  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0246294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  45.59 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  43.06 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  38.55 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  45.59 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  40.58 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  40.58 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  39.56 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  42.03 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  34.44 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  44.12 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 337 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  42.03 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  34.78 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>