More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2331 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  269  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  64.58 
 
 		 114 aa  120  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  60.42 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  61.05 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  40.87 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  46.34 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 		 119 aa  66.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  41.11 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  41.58 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  42.55 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  49.28 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  40.82 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  41.49 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  41.49 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  44.59 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  32.99 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 341 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  43.28 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  36.14 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  32.79 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 341 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  38.75 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  42.67 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>