More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2650 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  68.7 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  44.9 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  51.32 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  40.21 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  29.2 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  29.2 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  34.51 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  35.45 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  30.53 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  30.53 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  39.76 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  34.18 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  34.18 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  34.29 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  36 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  36 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  36 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  31.71 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>