More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1439 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 125 aa  243  9e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  53.12 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  53.12 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4600  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1708  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00199719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 317 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  34.82 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0790  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 238 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 265 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2344  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  46.88 
 
 		 305 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  43.66 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.99 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  36.99 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4486  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000320614  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  36.99 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  36.99 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0490  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  40.48 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2943  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00832197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 		 235 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  36.99 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1682  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 235 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  36.99 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  36.99 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2519  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0893  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509477  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2830  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2892  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0255  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.741592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  35.62 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  39.47 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 232 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3125  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 234 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 		 232 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  35.62 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 229 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 227 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4180  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 230 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0708963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2808  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 232 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  31.82 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  33.64 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3092  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 235 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 317 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2144  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 235 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  26 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  32.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  34.57 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  32.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>