More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12026 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  100 
 
 
118 aa  233  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  63.11 
 
 
119 aa  130  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  61.17 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  61.17 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  65.62 
 
 
115 aa  124  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  60.19 
 
 
119 aa  124  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  63.11 
 
 
119 aa  123  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  60.95 
 
 
119 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  64.36 
 
 
112 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  61.46 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  58 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  62.22 
 
 
109 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  59.78 
 
 
111 aa  107  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
107 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  58.24 
 
 
111 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  55.67 
 
 
110 aa  103  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  56.52 
 
 
111 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.92 
 
 
111 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  57.65 
 
 
118 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  54.02 
 
 
108 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  59.77 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  56.18 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  53.57 
 
 
168 aa  89.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
125 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  40 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  40.85 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
245 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  41.98 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  40.91 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  44.93 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  48.65 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  50.72 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
241 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  40.2 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
241 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  44.05 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  39.74 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  49.21 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
117 aa  53.9  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>