165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4189 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  69.39 
 
 
108 aa  142  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  69.39 
 
 
111 aa  140  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  69.52 
 
 
113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  65.42 
 
 
110 aa  136  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  66.36 
 
 
109 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  61.68 
 
 
111 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  70.41 
 
 
107 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  62.16 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  69.39 
 
 
151 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  62.62 
 
 
109 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  60.78 
 
 
125 aa  120  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  68.89 
 
 
168 aa  120  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.9 
 
 
111 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  54.29 
 
 
119 aa  113  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  65.38 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  55.24 
 
 
111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  50.89 
 
 
124 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 
119 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 
119 aa  100  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 
119 aa  97.1  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  53.61 
 
 
118 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  52.87 
 
 
115 aa  86.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  41.33 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  35 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  40.26 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  40.45 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
129 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
399 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
122 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  43.84 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  38.16 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  40.79 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  46.88 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  44.59 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
245 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
228 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  32.56 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  41.1 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
241 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
241 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
129 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
109 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
117 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
234 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>