299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0248 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 109 aa  214  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  60.82 
 
 		 105 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  60.82 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  32.97 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  35.64 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  32.98 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  27.84 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  30.93 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  37.37 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  26.8 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  27.84 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  36.79 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3928  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.479587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  39.8 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  50.88 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  33.94 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  48.15 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  49.12 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  29.7 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  37.63 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 330 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 134 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  31.31 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  39.39 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2519  regulatory protein ArsR  40.59 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>