More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4310 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  72.64 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  70.19 
 
 		 111 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 111 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  69.15 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  68.09 
 
 		 168 aa  131  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  70.65 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  67.02 
 
 		 109 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.46 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  67 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  60.78 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  59.79 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  66 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  53.06 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  46.02 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  57.65 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  41.33 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  36 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  40.32 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 399 aa  54.3  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1972  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  39.68 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  39.68 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  33.66 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  35.14 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  37.04 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  31.63 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 245 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  31.87 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  38.96 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  37.68 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.03 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.03 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  36.25 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  41.86 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  41.86 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  27.27 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  33.7 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  42.37 
 
 		 285 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>