More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1730 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
113 aa  227  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  85.59 
 
 
120 aa  198  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  70.37 
 
 
129 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  73.27 
 
 
118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  73.27 
 
 
118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  70.75 
 
 
135 aa  144  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  72.73 
 
 
127 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  73.47 
 
 
134 aa  141  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  72.73 
 
 
138 aa  140  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  70.83 
 
 
124 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  70.83 
 
 
124 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  70.83 
 
 
124 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  65.14 
 
 
119 aa  136  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  63.3 
 
 
128 aa  136  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  70.71 
 
 
126 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  70.41 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  68.75 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  70.83 
 
 
117 aa  131  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  64.15 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  73.47 
 
 
129 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  73.47 
 
 
129 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  67.01 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  67.01 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  63.73 
 
 
142 aa  123  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  73.68 
 
 
143 aa  120  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  69.79 
 
 
121 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  71.43 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 
134 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  66.02 
 
 
125 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  66.02 
 
 
145 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  66.02 
 
 
125 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  74.65 
 
 
94 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  63.44 
 
 
124 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  56.99 
 
 
132 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  58.33 
 
 
141 aa  90.5  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  53.93 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  36.96 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  46.05 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  39.53 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  35.87 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  47.14 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  37.37 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  48.57 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  40 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  38.03 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
120 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  36.63 
 
 
118 aa  60.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
297 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
93 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  38.27 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 
97 aa  60.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  39.24 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  34.67 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>