More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0777 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  85.71 
 
 
119 aa  201  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  78.15 
 
 
119 aa  187  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  77.31 
 
 
119 aa  186  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  76.47 
 
 
119 aa  180  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  69.64 
 
 
119 aa  157  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  65.09 
 
 
124 aa  143  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  60.19 
 
 
118 aa  124  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 
111 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  56.52 
 
 
109 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  55.88 
 
 
111 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
112 aa  107  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  46.23 
 
 
125 aa  104  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  46.02 
 
 
118 aa  103  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  48.98 
 
 
108 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  51.04 
 
 
111 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
117 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
117 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
117 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  51.69 
 
 
109 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  47.37 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  48.84 
 
 
168 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  46.84 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  31.87 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  43.01 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  41.56 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  41.56 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
118 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
118 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  39.77 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
235 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
117 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2952  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 
239 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.993569  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
241 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  43.84 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
241 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  35.56 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  41.33 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  31.71 
 
 
224 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1033  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
237 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
229 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
399 aa  55.1  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
245 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
337 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3452  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
234 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  36.99 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1841  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
251 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
106 aa  53.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  30.85 
 
 
232 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
232 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>