More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2463 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 110 aa  223  9e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  68.69 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  42.45 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  40.21 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  36.7 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  40.7 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  38.83 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  35.51 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  35.85 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  41.56 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  29.89 
 
 		 358 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  40.45 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  36.11 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  34.88 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  34.52 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  44.05 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  34.52 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  41.77 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  43.9 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>