More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
132 aa  261  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  57.6 
 
 
142 aa  134  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  65.05 
 
 
121 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  64.89 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  65.59 
 
 
124 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  54.13 
 
 
130 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  60.42 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  61.46 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  56.73 
 
 
126 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 
113 aa  105  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 
120 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  59.38 
 
 
117 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  52.14 
 
 
118 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  52.14 
 
 
118 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  56.12 
 
 
134 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  53.4 
 
 
128 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  54.37 
 
 
135 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  53.85 
 
 
129 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
124 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
124 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
124 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
127 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  57.89 
 
 
127 aa  100  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  52.43 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  56.04 
 
 
127 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  59.14 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  54.08 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  54.08 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  49.54 
 
 
143 aa  84.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  54.08 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  60 
 
 
94 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  50.48 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  48.7 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  50.48 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  38.54 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  35.62 
 
 
125 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
125 aa  57.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  32.61 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  34.58 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  40 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  35.53 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  28.43 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  30.69 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  38.57 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
111 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  39.77 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  39.02 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 
309 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  34.95 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
119 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2282  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
110 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  36.94 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  35.11 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>