195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3634 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
94 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  72.97 
 
 
134 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  71.62 
 
 
135 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  71.62 
 
 
120 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  65.85 
 
 
124 aa  105  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  65.85 
 
 
124 aa  105  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  65.85 
 
 
124 aa  105  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  71.23 
 
 
138 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  68.92 
 
 
136 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  68 
 
 
130 aa  103  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  68.92 
 
 
129 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  74.65 
 
 
113 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  71.23 
 
 
118 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  71.23 
 
 
118 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  68 
 
 
127 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  65.06 
 
 
117 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
128 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  67.57 
 
 
127 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  70 
 
 
127 aa  98.2  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 
119 aa  97.4  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  64.94 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  71.62 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  71.62 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  63.16 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  64.77 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  62.34 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  67.5 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  69.86 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  59.46 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  67.57 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  65.75 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  65.75 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  65.75 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  56.9 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2208  putative transcriptional regulator  50.68 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  43.9 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
119 aa  53.5  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  44.26 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  44.78 
 
 
168 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  38.18 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  43.4 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  36.99 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  48.08 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5679  putative transcriptional regulator  50 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.455024 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  53.06 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5331  putative transcriptional regulator  50 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0697124  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  41.03 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 
322 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  43.86 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  39.68 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
110 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
125 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2282  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  35.44 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  42.67 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.3 
 
 
329 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  46.43 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1004  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
341 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000308504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 
355 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  41.82 
 
 
114 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2472  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
119 aa  42.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  48.94 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>