More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3422 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
110 aa  224  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  88.18 
 
 
355 aa  202  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 
116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  60.78 
 
 
110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
113 aa  120  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 
302 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
188 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  37.35 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  34.31 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
309 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  35 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  32.94 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  38.57 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
125 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
121 aa  52  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  32.94 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
135 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 
124 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
102 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  31.71 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  38.67 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  36.36 
 
 
94 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  36.36 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  38.67 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2282  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
135 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
135 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
311 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  35.53 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08198  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862808  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  39.51 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 
307 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>